近年来,长春高新区着力提升自主创新能力,成为区域技术创新的辐射源。全区各类科技计划立项始终占全省的30%、全市的50%以上，累计实施火炬计划项目138个，国家863计划项目63个。全区申报专利总数达到近7000项。拥有省级以上名牌产品28项。建立了“长春·中国医药知识产权信息中心”，组建了吉林省“医药知识产权保护联盟”、吉林省软件出口联盟和汽车电子嵌入式软件企业联盟。高新区生产力促进中心被科技部认定为“全国示范生产力促进中心”。高新区海外学人创业园留学人员总数达到214名，创办企业178户，被批准为“国家留学人员创业园示范基地”、“中国侨联‘科教兴国’示范基地”。全区孵化基地面积发展到32万平方米，在孵企业380户，毕业企业820户，先后向区内外输送高新技术企业200余户，我省80％的自主创新型、处于初创期的中小科技企业集中在长春高新区。长春高新区创业中心被科技部评为“国家优秀创业中心二十强”。 先后支持400多户企业与大专院校、科研院所建立合作关系，建立了100余个产学研联合体、合作基地，实施合作项目200多项。全区大学、科研院所自创及与企业联合组建的高新技术企业已达450多户，区内重点高校和科研院所累计转化科研成果500余项。全区市级以上企业技术中心发展到60个，有15户企业被评为国家火炬计划重点高新技术企业。有6户企业荣获“全国民营科技企业创新奖”。全区高新技术企业研发投入占当年销售收入的比率平均达到5.6%，处于全国高新区一流水平。据《2006年中国开发区科技创新竞争力研究报告》，长春高新区在全国108家国家高新区和国家经开区中，被评为“中国科技创新竞争力十强开发区”之一。